El nombre de Ayutla significa “donde abundan las tortugas”, proviene de las voces ayotl_ tortuga y tla- sufijo que denota abundancia, San Pedro y San Pablo en honor de los fundadores de la iglesia.Ayutla al igual que otros pueblos de la Sierra Norte, han ofrecido culto al Rey Kondoy, máximo rey y divinidad de los mixes, personaje que expresa en su mito, leyenda o realidad perdida en la historia, la fortaleza de una nación prehispánica. Los sacrificios siempre han sido ofrecidos a Cong, juez supremo, dueño de todo lo que existe, el que nunca muere y que entró en el cerro ipxyukp, “Veinte Picos” (Zempoaltépetl, como lo conocían zapotecos y aztecas), y que allí todavía habita.
Extensión
La superficie total del Municipio es de 108.45 Km² que representan el 0.11% del total del estado.
Orografía
Este municipio cuenta con el cerro de la Cruz. que se considera el mas alto del municipio.
